怎样保护好专利中的商业秘密？商业秘密具有知识产权的特征，在实践中，一些商业秘密符合专利的标准，可以申请专利权，从而得到知识产权法的保护。但是在决定否采取专利保护方式之前，有以下几个需要注意的方面：

1.申请专利保护的成本高。

（1）人力成本。公司申请专利需要动员大量的人力，即使委托专利代理机构，仍需要一定的人员配合专利代理机构的工作。
（2）专利申请文件的制作费用。如果委托专利代理机构代理申请专利则要支付专利代理费。
（3）专利维持费。
 
2.专利申请的风险较大。
 
    如果一旦专利申请被专利行政部门驳回，则该技术持有人只能依据商业秘密制度进行保护。但由于在申请专利时，公司不得不将专利文件和有关专利材料项专利行政部门和有关人员公开，而且根据专利法第三十四条规定：国务院专利行政部门收到发明专利申请后，经初步审查认为符合本法要求的，自申请日起满十八个月，即行公布。国务院专利行政部门可以根据申请人的请求早日公布其申请。这意味着公司竞争对手可通过公开合法的渠道获得公司的技术开发情况。一旦公司的专利申请未能成功，公司不仅付出了一定的申请成本，而且该技术的商业秘密保护也面临威胁。
3.专利申请周期长。

    从专利申请到专利授予过程长，在该期限内，现行法律对在申请中的技术保护力度不足。
 
4.丧失对该技术的专有控制。

    《专利法》第四十八条规定，具备实施条件的单位以合理的条件请求发明或者实用新型专利权人许可实施其专利，而未能在合理长的时间内获得这种许可时，国务专利行政部门根据该单位的申请，可以给予实施该发明专利或者实用新型专利的强制许可。第四十九条规定，在国家出现紧急状态或者非常情况时，或者为了公共利益的目的，国务院专利行政部门可以给予实施发明专利或者实用新型专利的强制许可。因而专利制度体现了专利权人利益和社会利益的平衡。一旦公司对其专有技术选择了专利的保护方式，也就意味着公司放弃了其对该技术的垄断。

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